军人在犯罪后，其案件的处理程序根据犯罪地点和性质的不同而有所区别。以下是详细的处理流程：
军队内部犯罪
侦查阶段：现役军人在军队内部犯罪时，案件由军队保卫部门进行侦查。军队保卫部门负责收集证据、查明事实，并决定是否立案。
审查起诉：侦查结束后，案件将移送军事检察机关审查起诉。军事检察机关对案件进行审查，决定是否提起公诉。
审判阶段：如果军事检察机关提起公诉，案件将进入审判阶段，由军事法院进行审判，并依据《中华人民共和国刑事诉讼法》作出判决。
地方作案
案件移交：现役军人如果在地方作案，当地公安机关应当及时移交军队保卫部门进行侦查。
共同作案：
军队与地方人员共同在军队营区作案时，以军队保卫部门为主组织侦查，公安机关配合。
共同在地方作案时，以公安机关为主组织侦查，军队保卫部门配合。
审判程序
无论是军队内部还是地方作案，最终都将由人民法院对犯罪嫌疑人进行审判，确保审判的公正、公平和合法。
总结：
军人在犯罪后，其案件处理程序主要分为侦查、审查起诉和审判三个阶段。具体流程依据犯罪地点和性质的不同而有所调整，但总体上遵循《中华人民共和国刑事诉讼法》及相关规定，确保案件得到公正处理。