CIS设计的程序通常包括以下几个阶段：
企业实态调查阶段
企业内部调查：了解企业的内部运作情况、组织结构、企业文化等。
企业经营环境调查：分析企业所处的外部环境，包括市场状况、竞争对手、行业趋势等。
视觉表达系统审查：评估企业现有的视觉识别系统，包括标志、标准字体、色彩等。
形象概念确立阶段
基于调查结果，分析企业内部、外界认知、市场环境与各种设计系统的问题，拟订公司的定位与应有形象的基本概念。
设计作业展开阶段
根据企业的基本形象概念，转变成具体可见的信息符号，如企业标志、标准字体、色彩等。
进行精致作业与测试调查，确定完整并符合企业的识别系统。
完成与导入阶段
排定导入实施项目的优先顺序，策划企业的广告活动及筹组CI执行小组和管理系统。
将设计规划完成的识别系统加以制成标准化、规格化的手册或文件。
监督与评估阶段
对CIS的执行状况进行监督，确保符合原定的企业形象概念。
定期评估CIS的实施效果，提出检讨与修正。
此外，CIS设计还包括以下具体步骤：
原有标志分析：分析企业现有的标志，了解其设计元素和风格。
企业内外调查分析：对企业内部员工、管理层、合作伙伴以及外部消费者、市场等进行全面调查，收集信息。
确定企业定位：根据调查结果，明确企业在市场中的定位，包括企业理念、产品定位、市场定位等。
市场调查对象和内容：确定调查对象，如高中阶层主管、一般员工、合作厂商、经销商、代理商、消费群体等，并明确调查内容，包括企业思想、销售策略、企业状况等。
视觉媒体分析：分析企业本身和竞争同行的媒体现状，了解视觉传达的效果。
企业标准设计：包括企业标志、名称、品牌名称的标准字体设计，以及企业标准的色彩设计。
辅助要素设计：包括企业造型设计、象征图案设计、专用字体设计等。
基本要素整体组合设计：规定基本要素的整体组合方式，包括整体组合规定、变体设计和禁止的组合规定。
企业识别应用体系的设计发展：包括事务用品、员工制服、交通工具、企业建筑、环境、照明设施、招牌、旗帜、标识、商品包装、产品造型、商品展示与陈列、企业广告的识别设计等。
这些步骤和阶段共同构成了CIS设计的完整程序，旨在帮助企业建立统一、独特且易于识别的企业形象。