银行清分程序主要涉及以下几个步骤：
数据准备
清分是清算的数据准备阶段，主要将当日的全部网络交易数据按照各成员行之间本代他、他代本、贷记、借记、笔数、金额、轧差净额等进行汇总、整理、分类。
三级清分数据产生
各成员行对网络交换中心的清算净额。
各成员行互相之间交易的各类汇总。
当日的全部网络交易明细。
现金清分
银行现金清分工作流程包括：
现金验收：把钞票按照币种和面额分类，进行清点和鉴伪。
现金分类：把验收通过的钞票进行整理和分类，方便后续处理。
现金拆包：把包装袋或者纸箱里的钞票拆开，分成小束，方便后续处理。
现金清分、绑扎和封装：按照面额、币种、数量等要素进行分类，将同一类面额和币种的钞票统一绑扎和封装。
现金交接：将分类好、绑扎好并且封装好的钞票进行交接，包括内部交接和外部交接。
电子清分系统
银行普遍采用电子清分系统，清分工作就是按照银行要求，哪些业务进入本行清分，哪些业务进入人民银行的清分系统。同时，在审核清分业务时，要注重防止金融风险的发生。
现金清分员工作
现金清分员的工作包括将每天的交易单据属于本行、他行的进行梳理，便于与他行进行交换。例如，银行客户从本行支付货款去供应商所在开户银行（他行）。清分员还需要挑出假币和残缺污损人民币，将适宜继续流通的现金支付给社会公众。
建议
加强系统培训：确保所有相关人员熟悉清分系统的操作和功能，提高工作效率和准确性。
严格风险管理：在清分过程中，要严格遵守金融风险管理规定，防止假币和可疑交易的发生。
持续优化流程：根据实际业务需求和技术发展，不断优化清分流程，提高清分效率和安全性。