发酵鱼蛋白的程序主要包括以下几个步骤：
原料准备
需要从鱼类中提取出鱼肝油和鱼卵粉等主要原料，也可以通过化学或物理方法从低值鱼中提取。
添加其他成分如蒜瓣、光合细菌、枯草芽孢杆菌、放线菌、酶和苦皮藤根等。
细化处理
将废弃物细化处理后，加入适量的水，并搅拌均匀。
混合
将微生物菌种以及其它添加物加入到废弃物中，充分搅拌混合。
发酵
将混合物装入发酵容器中密封发酵。发酵过程中要保持适宜的温度和湿度条件，一般发酵温度控制在30℃-40℃之间，湿度保持在60%-80%之间。
发酵时间一般为7-10天，期间需要定期搅拌和通气，以确保微生物的活性和营养物质的充分分解。
后处理
发酵完成后，将发酵好的鱼蛋白肥料取出，晾干后即可使用。
部分制作方法还会将发酵产物进行进一步的处理，如过滤、浓缩和除水，以获得鱼蛋白氨基酸水溶肥。
这些步骤确保了鱼蛋白的有效发酵和营养物质的转化，最终得到可用于植物生长的肥料。建议在实际操作中根据具体条件微调工艺参数，以获得最佳效果。