修改公文的程序通常包括以下几个步骤：
审查修改申请
当需要对行政公文进行修改时，首先需要由相关部门负责人或领导审查修改申请。申请中应明确说明修改的原因和目的，并附上修改后的内容。审查过程中要注意公文的合法性、规范性，确保修改后的公文符合相关法律法规以及政府部门的政策要求。
内部讨论与审议
修改申请应提交给公文的起草人或者相关部门的内部讨论与审议。在这个过程中，各方可以就修改的具体内容进行讨论和提出修改意见。通过集思广益的方式，从不同角度审查修改申请，确保修改后的公文更加完善和准确。
审核与批准
根据内部讨论与审议的结果，修改申请应提交给上级领导进行最终的审核与批准。领导要对修改后的公文进行综合审查，包括公文的内容、格式、用词等，确保修改后的公文符合政府的工作要求。如果领导对修改申请存在异议，应当及时与申请人进行沟通，协商出最终的修改方案。
权限审批
修订与修改行政公文需要经过有权机关或人员的批准，确保修订与修改行为具有合法的授权和权威性。
审查校对
修订与修改行政公文需要由专人进行审查校对，确保修订与修改的结果符合要求。
修改核对
修订与修改行政公文进行核对，确保修订与修改的内容和格式都得到了妥善处理。
审批发布
修订与修改行政公文完成后，需经过相关部门的审批，确保公文的发布符合规范。
最终审核
在公文修改完成后，可能还需要进行最后的审核，确保所有内容、格式和用词都符合公文写作的要求，并且没有遗漏或错误。
通过以上步骤，可以确保公文修改的过程规范、严谨，最终形成符合要求的公文。建议在实际操作中，可以根据具体情况灵活调整步骤，确保公文修改的质量和效率。