更换学校公章的程序如下：
准备材料
营业执照的正本及副本原件。
法定代表人身份证原件及复印件。
经办人身份证原件及复印件（如果企业委托第三方办理）。
提交刻章卡上的全部旧章。
更换公章的申请书一式两份，加盖企业公章及法定代表人签字，并提供委托书一份加盖公章及法定代表人签字。
如果公章以前没有备案过，需要提交保证书及申请书。
提交申请
将上述材料提交至公安局的治安部门进行备案手续，并拿到回执。
刻制新公章
拿到回执后，申请人可以前往指定的印章刻制企业刻制新公章。
领取新公章
新公章刻制完成后，申请人需携带相关证明文件到公安分局综合服务大厅治安业务窗口，经审查批准并材料齐全后，可领取新公章。
建议
提前准备：提前准备好所有必要的材料，确保材料的真实性和完整性，避免因材料缺失导致更换流程受阻。
咨询相关部门：在正式办理之前，可以先咨询当地公安机关或学校的主管部门，了解具体的办理流程和要求，以确保顺利更换公章。