公司自建住房的程序主要包括以下几个步骤：
签订土地合同 ：包括一书方案、土地批准书、选址意见书，领取临时土地证。规划部门审批
到规划部门拿规划选址通知书。
凭选址通知书到设计院设计总平面，并经业主确认后送规划确认。
办理建设用地规划许可证和建设工程规划许可证。
环境影响评估
立项办好后到环科院做环境影响报告表，有污染的项目要做报告书，并报环保局审批。
地质勘探：
进行地质勘探，为施工提供准确数据。
施工图设计
到设计院设计方案文本，并经业主方和规划部门认可后设计施工图。
施工图设计好后报审图单位图纸审查。
办理施工手续
办理建设工程规划许可证。
到消防队办理消防审核意见书或备案。
同施工单位签订施工合同，并到合同办备案。
办理质监手续及建工处领取施工许可证。
临时用水用电审批
到自来水公司审批临时用水。
到电力公司审批临时用电。
施工准备
施工单位进场后到规划局测绘部门要求定位放样。
进入打桩工程，工程开始。
竣工验收
工程竣工后，进行竣工验收，并办理房屋所有权证。
产权登记
提供相关证件和税费项目，办理产权登记手续。
建议在实际操作过程中，公司应严格按照上述程序进行，并注意各环节的审批和备案要求，确保自建住房的合法性和顺利进行。