PLC程序的底层主要包括以下两个方面：
硬件层
这是PLC编程的最底层，包括PLC的物理构成，如CPU（中央处理器）、输入模块、输出模块、通信接口、存储器等。在硬件层面上，需要了解PLC的硬件连接、信号传输等基本知识。
运行系统层
这是PLC编程中的核心层，运行系统由操作系统、编程软件和驱动程序组成。在这一层次上，需要掌握PLC的运行原理、操作系统的功能和编程软件的使用方法。
此外，PLC编程的底层逻辑通常基于有向图的逻辑结构，使用梯形图（Ladder Diagram）、指令列表（Instruction List）、功能块图（Function Block Diagram）和结构化文本（Structured Text）等编程语言进行开发。这些语言都是专门为控制系统设计的，可以用来编写逻辑、执行控制和监控任务的程序。
综上所述，PLC程序的底层主要包括硬件层和运行系统层，编程语言则包括梯形图、指令列表、功能块图和结构化文本等。掌握这些基础知识是进行PLC编程的关键。