股权折价转让的程序主要包括以下几个步骤：
明确转让价格及原因
折价转让通常是基于双方协商的结果，需明确转让价格低于股权实际价值的原因，如公司业绩不佳、市场环境变化等。
签订转让协议
协议应详细规定转让价格、付款方式、股权交割时间等条款，以保障双方权益。转让协议需要明确转让价格、转让比例、付款方式等关键条款，以避免后续可能出现的纠纷。
进行工商变更登记
股权转让需在工商部门进行变更登记，以确保转让的合法性和有效性。变更登记时需提交相关文件，如股权转让协议、股东会决议等。
税务处理
折价转让可能涉及税务问题，如印花税、所得税等。双方应按照相关税法规定履行纳税义务，避免税务风险。
关注公司章程及股东协议
如果公司章程或股东协议对股权转让有特殊规定，应遵守相关规定。
召开公司股东大会
研究股权出售和收购股权的可行性，分析出售和收购股权的目的是否符合公司的战略发展，并对收购方的经济实力经营能力进行分析，严格按照公司法的规定程序进行操作。
聘请律师进行律师尽职调查
对潜在买家或卖家进行尽职调查，以确保交易的合法性和透明度。
实质性协商和谈判
出让和受让双方进行实质性的协商和谈判，确定最终的转让价格和条款。
上级主管部门批准
如果涉及国有资产，需向上级主管部门提出股权转让申请，并经上级主管部门批准。
评估和验资
对股权进行评估和验资，私营有限公司也可以协商确定股权转让价格。
办理纳税申报
出让方和受让方到主管税务机关办理纳税申报，确保税务合规。
办理变更登记手续
向工商行政管理局申请办理工商变更登记，将股权转让的信息变更到工商登记部门。
关注其他相关手续
包括职工大会或股东大会的召开、形成决议、签定股权转让合同或协议、审理合同及附件，并办理交割手续等。
通过以上步骤，可以确保股权折价转让的合法性和有效性，同时遵守相关法律法规，避免潜在的税务风险和纠纷。