医保药店的转让程序主要包括以下几个步骤：
签订转让协议
甲乙双方需签订详细的转让协议，明确双方的权利和义务，包括转让价格、支付方式、转让细节等。
准备相关材料
双方需准备以下材料：
变更申请书
新法人的身份证明
任职文件（如董事会决议）
原药店的营业执照正副本
药品经营许可证
税务登记证
其他相关许可证件（如食品经营许可证等）
申请变更药品经营许可证
向药品监督管理部门提交变更申请，填写相关表格并提交上述材料。药监部门会对药店的经营状况、资质等进行审查，审批通过后颁发新的药品经营许可证。
办理营业执照变更
在获得新的药品经营许可证后，需向市场监督管理部门提交营业执照变更申请，填写相关表格并提交新获得的药品经营许可证、营业执照正副本等材料。审核通过后，领取新的营业执照。
办理税务登记变更
在完成上述变更后，还需到税务部门办理税务登记变更手续，确保税务信息与新的营业执照信息一致。
办理其他相关变更手续
根据实际情况，可能还需要办理其他相关变更手续，如卫生许可证、社保登记证等。
完成过户手续
双方需携带相关证件，如新营业执照、新药品经营许可证、新印章等，前往相关部门办理过户手续，确保所有权和经营权顺利转移。
支付转让费用
转让价格已经支付完毕，甲方确认收到全部款项，不存在尚未结清的欠款。
保证与承诺
甲方需保证其转让的医保药店的设备、药品、资质等全部合法有效，不存在任何纠纷或争议。乙方保证将按照国家相关规定继续经营医保药店，保障医保患者的合法权益。
通过以上步骤，医保药店可以顺利完成转让程序，确保所有权和经营权的合法转移。建议在转让过程中咨询专业律师或相关部门，确保转让过程合规、顺利。