火车在站内临时停车的程序如下：
司机主动停车时
司机自行起动列车。
司机需要向车站值班员报告停车原因。
其他乘务人员使用紧急制动阀停车时
由运转车长（无运转车长为车辆乘务员）通知司机开车。
车站接发列车人员使列车在站内临时停车时
由车站按规定发车。
对于动车组列车，由车站通知司机开车。
其他原因的临时停车
车站值班员应会同司机、运转车长、车辆乘务员等查明停车原因。
在列车具备运行条件后，由车站按规定发车。
总结：
火车在站内临时停车的程序主要包括司机主动停车、其他乘务人员使用紧急制动阀停车、车站接发列车人员停车以及其他原因停车的处理。每种情况下，涉及的各方（如司机、车站值班员、运转车长、车辆乘务员等）都有明确的职责和操作步骤，以确保列车安全、迅速地恢复运行。