刷程序主要修改了以下内容：
行车电脑的数据：
刷程序是通过更改行车电脑（ECU）中的数据来调整发动机的参数，从而提升汽车的动力性能。
发动机参数：
这包括喷油量、点火提前角、断油点等。通过调整这些参数，可以优化发动机的燃烧效率和动力输出。
涡轮增压器的参数：
对于涡轮增压发动机，刷程序还会修改泄压阀等参数，以提升涡轮增压器的工作效率和发动机的输出功率。
进排气系统：
刷二阶和三阶程序时，可能需要进行进排气系统的升级，比如更换进排气歧管、安装中冷器等，以提高发动机的进气量和散热效率。
冷却系统：
由于发动机超频工作，刷程序可能会增加对冷却系统的依赖性。如果不进行适当的冷却系统升级，可能会对发动机的耐久性产生负面影响。
变速箱程序：
刷程序还可以调整变速箱的控制逻辑，改善换挡平顺性和工作效率。
油耗和耐久性：
虽然刷程序可以提升动力性能，但同时也可能导致油耗增加和发动机使用寿命缩短。
法律和保障问题：
刷程序可能使车辆失去4S店的保修服务，并且在出现故障时，车主可能需要自行承担维修费用。
综上所述，刷程序可以带来显著的动力性能提升，但同时也伴随着一定的风险和成本。在进行刷程序之前，车主应充分了解其潜在影响，并在必要时咨询专业人士的意见。