小程序警告的影响主要包括以下几个方面：
限制能力：
如果商家的小程序在规定的期限内未完成调整，可能会受到限制能力的处罚，例如封禁小程序服务的“被搜索”功能。
经济影响：
不合规的小程序可能面临罚款和赔偿，导致直接的经济损失。此外，用户流失和市场份额下降也会对盈利能力产生不利影响。
法律风险：
违反相关法律法规的小程序可能面临警告、罚款、暂停运营甚至永久关闭等处罚。不合规行为还可能引发法律诉讼，导致经济损失和品牌形象受损。
运营风险：
不合规的行为可能导致用户信任度降低，引发用户流失，影响与合作伙伴的关系。
信誉危机：
不合规的小程序容易引发负面评价，损害品牌形象和声誉，破坏用户对平台的信任。
监管加强：
不合规的小程序可能引发行业整顿，促使相关部门加强对整个市场的监管力度。
技术问题：
例如，小程序在开发过程中可能会出现技术警告，如sitemap问题，这可能会影响其他数据的显示和用户体验。
综上所述，小程序警告可能会对商家的运营、经济、法律和信誉产生多方面的负面影响。因此，建议商家在收到警告后，应立即进行整改，并确保在提交审核前完成所有必要的修改，以避免更严重的后果。