评估机构按程序评估的内容主要包括以下几个方面：
明确评估目的、对象和范围
在开始评估之前，评估机构需要明确评估的目的、对象和范围。这有助于确保评估工作的针对性和准确性。
签订评估委托协议书
评估机构与委托方（如房屋征收部门、企业等）签订评估委托协议书，明确双方的权利和义务。
实地勘察
评估机构指派专业人员对评估对象进行实地查勘，收集相关资料，核实资产信息，确保评估数据的可靠性。
选择评估方法和计算公式
根据评估对象的特点和评估目的，选择合适的评估方法和计算公式，进行评定估算。
形成评估报告
评估机构根据评估结果撰写评估报告，详细说明评估过程、方法和结果，并提交给委托方。
公示和复核评估结果
评估结果需要公示，以便相关方提出异议。对公示无异议的评估结果，评估机构会向委托方提供整体和分户评估报告。如果存在异议，可以向房地产价格评估机构申请复核评估，对复核结果仍有异议的，可以向房地产价格评估专家委员会申请鉴定。
内部审核和检验
评估机构需要对出具的评估报告进行内部审核和检验，确保评估报告的准确性和合规性。
提交评估报告
评估机构将最终审核通过的评估报告提交给委托方，并按规定报送相关材料和进行备案。
建立项目档案
评估机构需要建立项目档案，保存评估过程中的所有资料和文件，以备后续查询和审核。
这些步骤确保了评估工作的系统性、规范性和公正性，有助于保护各方利益，特别是被征收人的权益。建议在实际操作中严格按照上述程序进行，以确保评估结果的有效性和合法性。