手机系统的程序主要是指 操作系统。操作系统是管理和控制手机硬件与软件资源的计算机程序，是直接运行在“裸机”上的最基本的系统软件。任何其他软件都必须在操作系统的支持下才能运行。
目前市场上主流的手机操作系统有以下几种：
Android：
由Google开发，基于Linux平台的开源手机操作系统。它包括操作系统、用户界面和应用程序，是移动电话工作所需的全部软件。
iOS：
苹果公司的专属系统，以其流畅的用户体验和严格的应用审核著称。
Firefox OS：
由Mozilla开发，旨在提供开源和免费的移动操作系统。
YunOS：
阿里巴巴集团推出的基于Linux的移动操作系统。
BlackBerry：
由黑莓公司开发，主要用于企业市场。
Windows Phone：
由微软开发，现已停止支持。
Symbian：
曾经是诺基亚智能手机的主要操作系统，现已不再开发。
三星Tizen：
三星公司开发的基于Linux的移动操作系统。
这些操作系统不仅管理和控制手机的硬件资源，还为用户提供了丰富的应用程序运行环境。