医药工程建设程序通常包括以下几个主要阶段：
项目概况与前期准备
明确项目目标、建设内容、投资规模等基本信息。
进行市场调研、技术可行性分析、财务和经济评价。
确定建设地点、规划要点、征地及获取红线图等。
投资决策与审批
提交项目建议书、可行性研究报告等文件。
获得政府或相关部门的审批和批准。
确定资金来源和资金使用计划。
环境评价与安全性评价
进行环境影响评价，确保项目符合环保要求。
进行平安评价，确保项目建设和运营的安全性。
设计与规划
完成单体建筑设计，报规划部门审批。
进行地质勘探，获取详细的地质报告。
设计工艺流程和设施布局，确保技术可行性和生产效率。
招投标与合同签订
发布招标公告，进行投标评审，选择施工单位。
签订施工合同、监理合同等，明确各方责任和义务。
施工生产与质量监控
按照设计图纸和施工规范进行土建、钢结构、安装等工程施工。
聘请施工监理，对施工过程进行全程监控，确保质量达标。
进行材料采购和验收，确保材料质量符合要求。
调试与试生产
完成设备安装和调试，进行系统试生产，验证工艺流程和设备的可靠性。
进行初步的安全和环境测试，确保符合相关标准和要求。
竣工验收与认证
组织多部门参与的竣工验收，审查工程档案和实地查验。
对工程质量和安全进行综合评价，确保符合设计要求和相关标准。
获取GMP等认证，确保药品生产符合法规要求。
项目收尾与正式生产
完成工程尾项，处理遗留问题，进行工程结算。
正式投入生产，进行生产管理和运营。
建立和维护设备维护和管理体系，确保长期稳定运行。
后期评价与维护
进行项目后评价，总结经验教训，提出改进建议。
定期进行设备维护和检修，确保生产安全和产品质量。
以上是医药工程建设的一般程序，具体流程可能因项目特点、地区政策和法规要求等因素有所不同。建议在实际操作中，严格按照相关法规和标准执行，确保项目的顺利进行和成功完成。