纪律处罚程序主要包括以下几个步骤：
调查核实
对违纪行为进行认真核对调查，写出调查报告，并同违纪党员本人进行谈话，听取其对错误事实的说明和申辩。
提出处分建议
在调查核实的基础上，案件检查组会提出处分建议，包括处分的种类和依据。
支部委员会讨论
召开支部委员会，在案件检查组处分建议基础上，讨论对犯错误党员的处分意见，并草拟好处分决定。
支部大会讨论决定
召开支部大会，在充分讨论的基础上作出处分决定。党员大会应通知受处分的党员出席会议，允许本人申辩，也允许别人替他辩护。
逐级报上级党组织批准
一般情况下，党员的纪律处分必须经过支部大会讨论决定，报党的基层委员会批准。如果涉及的问题比较重要或复杂，或给党员以开除党籍的处分，应分别不同情况，报县级或县级以上党的纪律检查委员会审查批准。
特殊程序
在特殊情况下，县级和县级以上各级党的委员会和纪律检查委员会有权直接决定给党员以纪律处分。
材料见面与签署意见
党员大会通过处分决定后，应将处分决定和所依据的事实材料同本人见面，并让他在处分决定上签署意见，然后上报。
上级党组织批准
给予撤销党内职务以上的处分以及本人对处分有意见的，批准处分的党组织在审理过程中，应派人或委托下级纪委同受处分人谈话，听取本人对所认定的错误事实与定性处理的意见，同时对他进行必要的教育。上级党组织批准对党员的处分决定，必须经集体讨论决定。决定后应正式下达批复。
宣布执行处分决定
处分决定下达后，下级党组织应在适当范围内宣布，并通知犯错误的党员。
这些程序确保了纪律处罚的公正性和合法性，保障了党员的合法权益。