农村耕地征用的程序包括以下步骤：
办理用地申请
用地单位需要征用土地进行项目建设的，应当向土地所在地的区县国土房管局提交相关文件、资料，提出用地申请。
拟定征地方案
行政主管部门收到用地单位提出的用地申请后，应自申请之日起30日内拟定农用地转用方案、补充耕地方案、征用土地方案、工地方案。
征地审查
国土房管局根据各项征地相关方案编制建设项目呈报说明书，并报送同级人民政府审核。
征地审核与批复
行政主管部门收到建设项目呈报说明书和有关方案后，对文件资料齐全符合条件的，应当在5日内报经同级人民政府审核。
征用土地方案的公告
征用农民集体所有土地的，征用土地方案应当在被征用土地所在的村、组内以书面形式公告，其中征用乡（镇）农民集体所有土地的，在乡（镇）人民政府所在地进行公告。
制定征地补偿安置方案
区县国土房管局根据征用土地方案和征地补偿登记情况，拟定征地补偿、安置方案。
征地补偿、安置方案的公告
有关人民政府的国土房管部门会同有关部门根据批准的征收土地方案，在征收土地公告之日起45日内以被征收土地的所有权人为单位拟定征地补偿、安置方案并予公告。
补偿安置的实施
区县国土房管局应当依照征地补偿、安置费方案向被征用土地的农村集体经济组织和农民支付土地补偿费、地上附着物和青苗补偿费。
颁发建设用地批准书
完成以上步骤后，国土资源局向用地单位发出批准用地文件和《建设用地批准书》，被征地单位应在规定的期限内交出土地。
此外，还有一些补充程序：
发布土地征收预公告
县级以上地方人民政府认为符合《土地管理法》规定的，应当发布征收土地预公告，启动土地征收。预公告应当包括征收范围、征收目的、开展土地现状调查的安排等内容，并在拟征收土地所在的乡（镇）和村、村民小组范围内发布，预公告时间不少于十个工作日。
开展土地现状调查
县级以上地方人民政府对拟征收土地开展土地现状调查，应当查明土地的位置、权属、地类、面积，以及农村村民住宅、其他地上附着物和青苗等的权属、种类、数量等情况。调查结果通常在征收范围内公布。
开展社会稳定风险评估
县级以上地方人民政府对拟征收土地开展社会稳定风险评估，应当对征收土地的社会稳定风险状况进行综合研判，确定风险点，提出风险防范措施和处置预案。评估结果是申请征收土地的重要依据。
组织听证
多数被征地的农村集体经济组织成员认为征地补偿安置方案不符合法律、法规规定的，县级以上地方人民政府应当组织召开听证会，并根据法律、法规的规定和听证会情况修改方案。
这些程序旨在确保土地征用的合法性、公正性和透明度，保护被征地农民的合法权益。建议在实际操作中严格按照这些程序进行，以确保征地的顺利进行和合法合规。