补充侦查是依照法定程序，在原有侦查工作的基础上，进一步查清事实，补充完善证据的诉讼活动。根据《中华人民共和国刑事诉讼法》的相关规定，补充侦查的程序主要涉及以下几种情况：
审查批捕阶段的补充侦查
根据《刑事诉讼法》第68条的规定，人民检察院对于公安机关提请批准逮捕的案件进行审查后，如果决定不批准逮捕，应当说明理由，并且如果需要补充侦查，应当同时通知公安机关。
审查起诉阶段的补充侦查
根据《刑事诉讼法》第140条的规定，人民检察院在审查案件过程中，如果发现需要补充侦查，可以将案件退回公安机关补充侦查，也可以自行侦查。补充侦查应当在1个月以内完成，并且以2次为限。补充侦查完毕移送人民检察院后，人民检察院需要重新计算审查起诉期限。
法庭审理阶段的补充侦查
根据《刑事诉讼法》第165条和第166条的规定，在法庭审理过程中，如果检察人员发现提起公诉的案件需要补充侦查，并提出补充侦查建议，人民法院可以延期审理。补充侦查应当在1个月以内完成，并且以2次为限。补充侦查完毕移送人民检察院后，人民法院可以继续审理案件。
建议
明确补充侦查的情形：在实际操作中，应当明确何时需要补充侦查，避免因证据不足或事实不清而多次补充侦查，影响诉讼效率。
规范补充侦查程序：补充侦查必须遵循法定程序，确保补充侦查的合法性和有效性。
加强监督：人民检察院和人民法院应当对补充侦查的过程进行监督，确保补充侦查的质量和及时性。
通过以上程序，可以确保刑事案件在侦查、审查起诉和审理阶段都能充分查明事实，收集到充足的证据，从而保障司法公正和效率。