鉴定程序合法是指司法鉴定活动必须严格遵守国家法律、法规的规定。这一原则在立法和鉴定过程中主要体现为以下几个方面：
鉴定主体合法
司法鉴定机构必须是按法律、法规、部门规章规定，经过省级以上司法机关审批，取得司法鉴定实施权的法定鉴定机构，或按规定程序委托的特定鉴定机构。
司法鉴定人必须是具备规定的条件，获得司法鉴定人职业资格的执业许可证的自然人。
鉴定材料合法
鉴定对象必须是法律规定的案件中的专门性问题，法律未作规定的专门性问题不能作为司法鉴定对象。
鉴定材料的来源（含提取、保存、运送、监督等）必须符合相关法律规定的要求。
鉴定程序合法
包括司法鉴定的提请、决定与委托、受理、实施、补充鉴定、重新鉴定、专家共同鉴定等各个环节上必须符合诉讼法和其他相关法律法规和部门规章的规定。
鉴定步骤、方法、标准合法
鉴定的步骤、方法应当是经过法律确认的、有效的，鉴定标准要符合国家法定标准或部门（行业）标准。
鉴定结果合法
鉴定结果的合法性，主要表现为司法鉴定文书的合法性。鉴定文书必须具备法律规定的文书格式和必备的各项内容，鉴定结论必须符合证据要求和法律规范。
综上所述，鉴定程序合法要求整个鉴定过程从主体资格、材料来源、程序步骤、方法标准到结果文书等各个环节都必须严格遵循国家相关法律法规，确保鉴定活动的科学性、规范性和公正性。