程序与实体的冲突主要是指 在司法过程中，程序正义与实体正义之间可能出现的价值冲突。具体表现如下：
程序正义的实现不依赖于实体正义 ：程序正义是指在司法程序中，所有参与者应遵循公平、公正、公开的原则，确保每个人都能得到公正的对待。而实体正义则是指司法结果符合事实真相和法律规定，维护社会公平正义。程序正义的实现并不完全依赖于实体正义，即使实体结果存在不公正，程序正义仍然可以通过完善的程序来保障。程序正义与实体正义可能发生价值冲突：
在司法实践中，程序正义和实体正义可能会发生冲突。例如，为了确保证据的合法性，可能会排除某些证据，即使这些证据对证明事实至关重要。这种情况下，程序正义得到了维护，但实体正义却受到了影响。
不同观点对程序与实体冲突的处理
实体优先论：
认为实体是最终目的，程序只是实现这一目标的工具。当程序与实体发生冲突时，实体正义应优先于程序正义。
程序优先论：认为程序公正是司法公正的逻辑起点，程序具有其独立的价值。当程序与实体发生冲突时，程序正义应优于实体正义。
并重论：认为实体与程序是相辅相成的，应并重对待。在发生冲突时，需要平衡两者的关系，不能过分偏重任何一方。
理想与现实
理想的公正结果是程序正义和实体正义的一致。但由于人类认识的局限性和程序本身的不完善性，两者之间不可避免地会产生冲突。
在实际案例中，如果一味追求实体正义而忽视程序正义，可能导致冤假错案的发生，破坏司法公正的形象。相反，如果过分强调程序正义而忽视实体正义，也可能导致司法结果的不公正。
建议：
在司法实践中，应综合考虑程序正义和实体正义，寻求两者之间的平衡。一方面，要完善司法程序，确保程序正义的实现；另一方面，也要追求实体正义，确保司法结果符合事实真相和法律规定。通过这种平衡，可以实现司法公正，维护社会的公平正义。