开除员工的合法程序包括以下几个步骤：
明确解除理由
企业应根据《劳动合同法》的相关规定，明确解除劳动合同的理由。这些理由可能包括员工严重违反规章制度、不能胜任工作、严重失职等。
企业需要收集相应的证据来支持其决定，例如《规章制度签收确认函》、《员工处罚通知书》、《培训记录表》等。
通知工会
如果企业设有工会，那么在作出开除决定前，应事先将理由通知工会。工会有权提出意见或建议，企业应当认真考虑工会的意见。
书面通知员工
在确定解除理由并征得工会同意（如有）后，企业应向员工发出单方解除劳动合同的书面通知书。这份通知书是企业开除员工的关键法律文件，其内容必须准确、完整、合法。
提供解雇补偿
企业需要按照相关法律法规支付解雇补偿金，包括经济补偿金、代通知金、社会保险费等。
办理离职手续
企业需要为员工办理离职手续，包括结算工资、退还公司财物、交接工作等。
保存相关文件
企业需要保留解雇通知书、员工档案、考勤记录等相关文件，以备后续查证。
履行其他法定程序
根据具体情况，企业可能还需要履行其他法定程序，例如对员工进行警告、纠正等，以确保员工有机会改正自己的错误。
建议
企业在开除员工时，务必严格遵守《劳动合同法》及相关法律法规，确保程序的合法性和合规性，以避免可能的法律风险。同时，企业应充分尊重员工的权益，确保通知工会和提供补偿等步骤得到妥善执行，以维护良好的劳动关系和企业形象。