巡视整改工作存在的问题和不足主要包括以下几个方面：
问题意识不强
一些被巡视单位对存在的问题意识不够明确，可能认为自身做得已经很好或问题规模不大，没有及时采取有效的整改措施，导致整改效果不佳，甚至出现反弹。
整改措施缺乏科学性和针对性
部分被巡视单位在整改时，缺乏科学性和针对性，仅进行形式主义的工作，缺少深层次的思考和解决方案，无法真正解决根本问题。
部分干部态度消极
有些干部对巡视整改持消极态度，认为整改是上级给自己找麻烦，敷衍塞责，不积极推动整改工作的落实，影响整个机关单位的工作氛围和效率。
管理体制和机制不完善
在进行巡视整改时，一些单位发现管理体制和机制不够健全，存在职责不明确、权责交叉、监督机制薄弱等问题，导致巡视整改工作的混乱和难度加大。
巡视整改信息公开不透明
一些被巡视单位在整改过程中，对整改信息公开不透明，隐瞒整改进展情况，甚至故意掩盖问题，损害信任和透明度建设。
审计监督力度不够
在巡视整改过程中，有时缺乏审计监督的力度，未能有效发现和纠正各类违纪违法行为。
整改措施缺乏针对性
被巡视单位对指出的问题往往仅采取形式上的回应，没有真正理解其中深层次的原因和根本症结，导致整改措施不具备针对性。
工作责任制执行不到位
由于个别领导干部职责分工模糊或失职失责，部分问题得不到及时发现和纠正，需要完善工作责任制度，强化领导干部履行职责的意识。
检查评估机制薄弱
在巡视整改阶段，缺乏对整改工作效果的检查评估机制，可能导致敷衍塞责或不敢真正解决问题。
整改力度不够大
在给出整改要求后，有时采取了姑息迁就的态度，没有及时跟进和追究责任，需要强化对被巡视单位实施监督和落实整改要求。
制约因素仍然存在
在某些地区或部门，仍然存在形式主义、官僚主义等现象，严重制约了巡视整改工作的开展。
宣传推广不到位
在普及巡视工作方法和成果上还存在较大欠缺，有效宣传推广巡视情况，可以提高社会意识，促使更多人关注并支持党风廉政建设。
整改重点分散
各级政府都在努力做很多事情，但都没有确定一个具体的工作重点，缺乏统一管理和协调。
整改工作缺乏远见
政府机构和企业往往只看到当前的问题，没有考虑到今后的发展，缺乏对长远发展的策略性规划。
整改工作缺乏约束力
在监管机构和行业组织的监督下，整改工作能够实现一定的效果，但没有足够的法律制度来约束和惩戒违规行为，影响整改工作的效果。
整改责任落实不到位
有些领导干部虽然表示重视，但并没有真正采取行动解决，有些单位和个人对整改工作持观望态度，缺乏切实履行整改责任的意识。
基层党组织弱化
基层党组织建设存在明显薄弱之处，如基层党员队伍结构性问题突出，基层党组织自身能力不足。
部分干部思想麻痹松懈
一些领导干部在职务长期稳定后出现思想麻痹和精神濒临松懈状态，失去敬畏之心，缺乏积极性和创造力。
重点领域管理薄弱
在环境保护、安全生产、食品药品监管等领域，存在监管措施不严格、执法力度不大和违法成本较低等问题。
部门协调合作不畅
由于信息不畅通或利益冲突等原因，在整改过程中协调合作常常面临挑战，缺乏有效沟通和协商机制。
整改思路和方法不够科学
被巡视单位可能缺乏对问题的深入剖析和细致研究，导致整改思路不够科学，直接套用其他地方或类似情况的整改方案。
部分干部对巡视理解偏差
一些干部在面临巡视时，常常演变为简单迎检应付，没有认识到真正重要的是自我反省、查找问题并及时整改。
系统性障碍
存在一些系统性障碍，影响巡视整改工作的全面性和有效性。
落实工作慢，有拖延现象
一些单位在落实整改工作时存在拖延