莫西干人灭绝的原因是多方面的，主要包括以下几点：
自然环境的变迁
欧洲殖民者到来后，对莫西干人生活的地区进行了大规模的资源开发和环境破坏，如砍伐森林和破坏湿地。
引入的新疾病，如天花和麻疹，在莫西干人中迅速传播，导致大量人口死亡。
文化冲突与战争
莫西干人与欧洲殖民者在资源争夺、土地分配等方面产生了严重矛盾。
欧洲人带来的农业和畜牧业生产与莫西干人的狩猎和捕鱼生活方式相冲突。
社会制度的瓦解
面对外部压力，莫西干人内部出现了分裂，一部分选择与殖民者合作，另一部分坚持抵抗，加剧了内部矛盾。
文化传承的断裂
随着莫西干人的灭绝，他们的语言、艺术、宗教等知识逐渐失传，独特的历史文化遗产面临消失的危险。
外部侵略和大屠杀政策
17世纪美国独立后，实施了对印第安人的灭绝政策，将他们赶出祖地，并进行了种族清洗。
16-19世纪期间，多个国家对印第安人实施了灭族政策，导致人口锐减。
迁移和人口减少
1664年，莫西干人被摩和克人驱赶，经历了死伤惨重的迁移过程。
经过这些事件，莫西干人的人口数量大幅减少，从原先的较大群体缩减至现今的约1000人左右。
总结来说，莫西干人的灭绝是一个由自然环境变化、文化冲突、社会制度瓦解、疾病流行、外部侵略政策以及人口迁移和减少等多种因素共同作用的结果