单倍体育种的原理是利用植物组织培养技术，特别是花药离体培养，来诱导产生单倍体植株。单倍体是指具有体细胞染色体数为本物种配子染色体数的生物个体。接着，通过某种手段（如秋水仙素处理）使染色体组加倍，从而使植物恢复正常染色体数，成为纯合体。这个过程涉及染色体变异，即从配子直接发育成植株，省去了传统杂交育种中多代分离和选择的复杂过程。单倍体育种的优点在于可以大大缩短育种时间，但技术相对复杂，通常需要与其他育种方法如杂交育种配合使用。