酶切位点保护碱基表如下:
| 酶 | 寡核苷酸序列 | 链长 | 切割率% |
|------|--------------|------|---------|
| Not I | GCGGCCGCTATAAA | 10 | 100 |
| Nsi I | GCGGCCGCTATAAA | 10 | 100 |
| Acc I | GGTCGACC | 6| 0 |
| Afl III | CACATGTG | 6| 90 |
| Asc I | GGCGCGCC | 6| 90 |
建议在酶切位点两端至少加上6个保护碱基,以确保酶切反应的进行。