根据《国有土地上房屋征收与补偿条例》的规定， 不应对被征收房屋的国有土地使用权另行补偿。具体理由如下：
补偿项目的规定
《国有土地上房屋征收与补偿条例》第十七条规定的补偿项目包括：被征收房屋价值的补偿、搬迁和临时安置的补偿、停产停业损失的补偿。这些项目中并未包含国有土地使用权的补偿。
国有土地使用权价值的包含
国有土地使用权的价值应包含于被征收房屋价值之内。因此，对被征收人国有土地使用权损失的补偿应包含于被征收房屋价值损失的补偿之内。
评估报告的依据
如果房屋评估报告确实未包含土地使用权价值的，应当视为评估报告明显依据不足，应当准许被征收人申请重新鉴定。
综上所述，根据《国有土地上房屋征收与补偿条例》的规定，被征收房屋的国有土地使用权不应另行补偿，其价值应包含在被征收房屋价值之内，并在评估报告中予以体现。如果评估报告未包含土地使用权价值，被征收人有权申请重新鉴定。