施工合同补充协议是在原有施工合同的基础上，为了进一步明确双方的权利和义务，对原合同进行修订或补充所形成的协议。补充协议通常包括以下内容：
工程内容及范围：
明确施工的具体内容、范围以及施工图纸所含的所有工作。
工程支付方式：
详细规定工程款项的支付方式，包括支付比例、支付时间以及质保金的支付条件和时间。
施工期限：
确定动工、施工、完工的日期，以及可能出现的延期情况及相应的处理措施。
工程计价及结算：
明确工程计价方式、结算方法以及材料价格波动的处理办法。
违约责任：
规定违约情况下的责任承担，包括违约金、赔偿金额等。
安全施工与检查：
明确安全施工的要求、事故处理程序以及文明施工的标准。
工程变更：
规定工程变更的程序、责任划分以及费用承担。
争议解决：
约定争议解决的方式，如协商、仲裁或诉讼等。
其他事项：
包括合同的生效日期、有效期限、双方通讯地址等。
署名：
双方签署补充协议，并注明签署日期。
补充协议的订立应遵循平等、自愿、互利、诚信的原则，确保协议的合法性和有效性。在签订补充协议时，应注意与原合同的条款保持一致，避免产生冲突。如有必要，可聘请专业法律人员进行审核。