小程序公司账号交税的方式如下：
按收入比例缴税
小程序公司账号的收入所得需要按照《增值税暂行条例》和《个人所得税法》等相关法规的规定，依法申报缴纳增值税和所得税。缴税的比例根据公司的类型（小规模纳税人或一般纳税人）和具体的税收优惠政策而定，小规模纳税人通常适用3%的税率，一般纳税人则适用17%的税率。
对公账户进出账缴税
无论是公司之间的转账还是单位对单位的转账，只要资金流入对公账户，都需要缴纳相应的税款。对公账户的收入所得也需要按照收入比例来缴税，很多企业实际是按发票金额来缴税。
发票管理
小程序平台上的交易，发票由入驻商家开具。如果商家未开具发票，则视为未交税。因此，商家必须确保每笔交易都有相应的发票开具，以符合税务规定。
税收优惠政策
国家对小规模企业有一定的税收扶持力度，例如一个季度有45万元的免征增值税额度。企业可以根据自身情况合理利用这些政策来降低税负。
税务申报
企业需要按照税务机关的要求，定期进行税务申报，包括填写各类税务表格和提交必要的证明材料。未按照规定进行税务申报的企业可能会面临补缴税款和罚款的风险。
税务检查
税务机关会定期对企业的对公账户进行检查，确保企业依法纳税。如果发现企业存在未开票未缴税的收入信息，将需要补缴税款和缴纳罚款。
综上所述，小程序公司账号交税需要遵循相关税法规定，按收入比例缴税，并确保对公账户的进出账有合法依据和发票支持。同时，企业可以利用国家提供的税收优惠政策来降低税负，并按时进行税务申报和检查，以避免不必要的法律风险。