企业小程序主体的修改流程如下：
了解相关规定和要求
在开始之前，需要了解小程序主体变更的规定和要求，以确保符合平台的政策和流程。不同的小程序平台可能有不同的要求和限制。
准备所需资料和证件
确保公司的相关证件和资料是完备的，包括营业执照、法人身份证明、公司公章等。这些文件通常会在变更流程中需要使用。
登录小程序管理后台
使用之前注册小程序的账号登录到对应的小程序管理后台。不同平台的登录方式可能会有所不同，一般情况下，可以通过官方网站登录。
进入小程序设置
登录到小程序管理后台后，找到并进入小程序的设置页面。具体位置可能因平台而异，通常在"设置"或"基本信息"等栏目下。
查找主体变更选项
在小程序设置页面中，寻找与主体变更相关的选项。这个选项可能会被称为"主体变更"、"主体迁移"或类似的名称。
填写变更申请
进入主体变更页面后，根据要求填写相关的信息和资料。可能需要上传公司证件的扫描件或照片，并填写法人或负责人的个人信息。
提交申请并等待审核
填写完成后，提交主体变更申请。然后，等待平台的审核。审核时间可能因平台和具体情况而异，通常需要耐心等待。
按照平台要求补充资料
如果审核过程中，平台需要补充资料或进行进一步核实，及时提供所需的材料和信息。
审核通过后更新信息
一旦审核通过，根据平台的指引，可能需要更新小程序的相关信息，如公司名称、法人信息等。
注意事项：
小程序主体不支持变更为个人类型。
小程序主体变更无需注册新的小程序账户。
小程序主体变更完成后，将释放原主体的注册数量。
变更主体时，需要提供注销主体和新主体的相关信息，并对变更申请函进行公证。
变更主体审核时间一般为3-7个工作日，具体以实际进度为准。
建议：
在进行小程序主体变更前，仔细阅读平台的相关规定，确保所有资料齐全且符合要求。
如果对变更流程不熟悉，可以通过微信公众平台服务商或专业的第三方机构协助办理，以确保变更过程顺利。