当遇到审批程序错误时，可以采取以下步骤进行处理：
及时告知并提醒改正
如果你是直接管理者且了解相关审批事项，应立即告知犯错误的同事，并给予改正的机会，避免损失扩大。可以通过私下聊天或邮件的方式，以善意的方式提醒对方。
了解错误原因并协助补救
如果对同事的工作内容了解不够充分，应委婉提出疑问，请同事帮助解释，以此作为提升自身知识面和工作能力的机会。
联系第三方追回或重新计算
如果行政审批结果已经发出，应协助同事联系第三方，说明情况并请求追回原结果，同时表达歉意，并确定新的交付时间。如果结果尚未发出，可以一起计算需要更正的内容。
共勉并互相提醒
问题解决后，应与同事共同总结经验教训，互相提醒以后避免犯类似错误，并在工作中更加认真仔细。
遵循法律程序进行更正
对于程序违法的行政许可，被许可方有权向许可权的主体提出修改许可内容的申请，需遵循法律规定的程序进行更正。
撤销原许可并重新作出
在某些情况下，如果行政许可程序违法，可以依法撤销原许可，并重新作出行政许可决定。有权机关应依照规定的程序实施处罚，并对直接负责的主管人员和其他直接责任人员依法给予行政处分。
通过以上步骤，可以有效地处理审批程序错误，减少损失，并促进工作中的严谨性和责任心。