当遇到法官程序违法的情况时，可以采取以下措施进行处理：
当事人或相关利益方可以通过提出异议或上诉的方式，向上一级法院或相关监督机构反映情况。在提出异议或上诉时，应详细说明法官办案程序违法的具体情况，并提供相关证据材料。法院或监督机构会对相关情况进行调查核实，并根据情况采取相应的处理措施。
当事人也可以向有关机关或部门举报法官的违法行为，要求追究其法律责任。对于法官办案程序违法的行为，一般会采取发回重审的处理方式，并由法院内部对涉事法官进行相应的处罚。
如果法官的违法行为情节严重，涉嫌犯罪的，可以向检察院举报控告。如果觉得虽然违法违纪但未构成犯罪，可以向监察委或者法院举报控告。
当事人还可以通过审判监督程序向上级法院或检察院申诉，要求对违法审判程序进行纠正，维护自身合法权益。
总之，对于法官办案程序违法问题，应依法进行严肃处理，确保司法公正和效率。同时，还应加强对司法活动的监督和制约，防止类似问题的再次发生。