企业申请微信小程序的企业认证流程如下：
注册微信公众号
首先，企业需要在微信公众平台注册一个微信公众号。在注册过程中，需要提供企业相关的基本信息，如企业名称、营业执照等，并完成身份认证。
提交认证申请
注册完成后，登录微信小程序管理后台，在“设置”-“账号信息”中找到“小程序认证”选项，填写相关信息并上传企业资质证明文件，如企业营业执照、组织机构代码证、税务登记证等。
等待审核
提交认证申请后，需要等待微信官方的审核结果。审核时间一般为1-5个工作日，审核结果会通过微信公众平台消息通知的方式通知申请人。
认证成功
如果审核通过，企业的小程序将获得官方认证标识，可以在小程序名称后面显示“认证标志”，并且可以享受微信提供的认证后特权，如“服务类目”、“接口权限”等。
建议
提前准备资料：在申请认证前，确保所有必要的资料都已准备齐全，包括营业执照、组织机构代码证、税务登记证、法人身份证等，并确保所有文件都是最新的和有效的。
仔细填写信息：在提交认证申请时，务必仔细填写所有信息，并确保信息的真实性和准确性，避免因信息错误导致认证失败。
及时关注审核进度：在等待审核期间，定期检查微信公众平台的消息通知，以便及时了解审核进度和结果。
通过以上步骤，企业可以顺利完成微信小程序的企业认证，从而提升小程序的权威性和可信度。