微信小程序的认证交费方式主要有以下几种：
商家缴纳
商家可以通过微信支付的商家平台，将认证审核费用直接支付给腾讯公司。支付完成后，平台会向小程序账号管理员的微信下发支付通知模板消息，同时提供支付地址或二维码，管理员需在24小时内完成支付。
服务商代缴
服务商可以批量采购认证费代交服务额度，选择通过划扣额度完成认证费用的支付。商家无需自行交费，服务商在代交过程中会扣除相应的服务费用。
微信认证
对于没有对公账户的商家，可以选择微信认证。认证费用为300元，支付完成后，腾讯会返还几毛钱作为注册验证的费用。微信认证自带微信支付功能和小程序开发功能。
对公打款
部分情况下，用户可以选择通过对公账户打款的方式进行认证费用支付。认证费用为300元，支付完成后，需要等待腾讯公司的审核电话，通常审核时间为1-3个工作日。
建议
选择支付模式：根据商家自身情况选择最便捷的支付模式，如果已有认证过的公众号，可以使用公众号关联的小程序快速注册和认证，这样可以省去自行支付认证费用的步骤。
确认支付信息：在支付过程中，务必仔细核对支付信息，确保支付成功并留意腾讯公司的通知，以便及时完成认证流程。