编写加密系统程序需要遵循以下步骤：
选择加密算法
确定要使用的加密算法，如DES、AES、RSA等。这些算法在C语言中可能需要使用相应的库函数或者自己实现。
输入明文
从用户处获取要加密的明文。在C语言中，可以使用`fgets`或`scanf`函数来读取输入。
设置密钥
确定加密过程中使用的密钥。密钥可以是用户输入的，也可以是通过其他方式生成的。
进行加密
根据选定的加密算法和密钥，对明文进行加密运算，得到密文。在C语言中，可以使用位运算、异或运算等简单方法来实现加密。
输出密文
将生成的密文输出给用户。可以使用`printf`函数来显示密文。
```c
include
void encrypt（char *plaintext, char *key） {
int i；
for （i = 0； i < strlen（plaintext）； i++） {
plaintext[i] = plaintext[i] ^ key[i % strlen（key）]；
}
}
int main（） {
char plaintext；
char key；
printf（"请输入明文： "）；
fgets（plaintext, sizeof（plaintext）, stdin）；
printf（"请输入密钥： "）；
fgets（key, sizeof（key）, stdin）；
encrypt（plaintext, key）；
printf（"加密后的密文为： %s\n", plaintext）；
return 0；
}
```
建议
安全性：对于实际应用，建议使用经过验证的加密库和算法，以确保安全性。
性能：根据实际需求选择合适的加密算法和密钥长度，以平衡安全性和性能。
错误处理：在编写程序时，应考虑输入验证和错误处理，以确保程序的健壮性。
通过以上步骤和示例代码，你可以编写一个简单的加密系统程序。对于更复杂的需求，建议深入研究相关的加密算法和库函数。