PCR(聚合酶链反应)扩增程序通常包括以下几个步骤:
预变性
将反应混合物加热至94-98°C,以激活DNA聚合酶。这个步骤的时间取决于所使用的聚合酶。预变性的目的是使DNA模板充分变性,变成单链状态,以便后续的引物能够与之结合。
变性
将反应混合物加热至94-98°C,并保持20-30秒,以破坏两条链之间的氢键并生成单链DNA分子。这个步骤是PCR循环中必不可少的一部分。
退火
将温度降至55-60°C(具体温度根据引物和模板的互补性而定),并保持30秒,使引物与单链DNA模板充分退火。退火的目的是让引物找到其互补的序列,并与模板结合。
延伸
将温度升至72°C,并保持30秒,使引物在模板上延伸,合成新的DNA链。这个步骤是PCR循环中合成新DNA的关键步骤。
循环
重复上述变性、退火和延伸步骤25-35次,使扩增的DNA片段大量累积。循环次数取决于所需的扩增量和扩增效率。
末次延伸
在最后一次循环结束后,将反应管置于72°C温育5分钟,以确保所有DNA片段都延伸完整。这一步有助于消除任何未完全延伸的产物。
保存
将扩增产物冷却至4°C保存,以便后续的分析和处理。
示例PCR扩增程序
预变性
94°C,3分钟
循环
94°C,30秒
55°C,30秒
72°C,30秒
重复上述步骤25-35次
末次延伸
72°C,5分钟
保存
4°C保存
这个程序适用于大多数常规的PCR实验,具体参数可以根据实验需求和引物设计进行调整。