小程序公司上税主要涉及以下几个方面：
增值税
微信小程序入驻商家的混合销售额增值税率为6%。
商家产生的交易，发票由入驻商家开具，不开发票不交税。
对公账户的收入所得需要按照收入比例缴纳增值税。
个人所得税
公司员工的个人所得税需要代扣代缴，通常按季度申报。
企业所得税
企业所得税通常按季度申报，具体申报时间和流程需要参照当地税务部门的规定。
其他税种
根据公司所属行业和地区的不同，可能还需要缴纳其他税种，如印花税、房产税等。这些税种的具体申报和缴纳方式也需要咨询当地税务部门。
缴税方式
可以通过网上申报，也可以到税务局现场申报。网上申报通常更为便捷，需要公司开通网上申报系统并进行相关设置。
建议
咨询专业人士：由于税收政策可能会有所变动，建议咨询专业的财务会计或税务顾问，以确保准确合规地缴纳税款。
保留凭证：确保所有交易都有相应的发票和凭证，以便在申报时能够提供完整的财务记录。
按时申报：按时申报各项税款，避免因延迟申报而产生不必要的罚款和滞纳金。
希望以上信息对你有所帮助。如果有更多具体问题或需要更详细的指导，请随时咨询相关专业人士。