程序违法的惩罚措施主要依据违法的性质、严重程度以及造成的后果来确定。以下是一些常见的法律后果：
行政处罚
责令改正：有权机关违反法定程序实施行政处罚的，由上级行政机关或者有关部门责令改正。
行政处分：对直接负责的主管人员和其他直接责任人员依法给予行政处分。
国家赔偿：如果因程序违法给行政处罚相对人造成损失的，可以申请国家赔偿。
行政许可
撤销许可：对违反法定程序作出准予行政许可决定的，作出行政许可决定的行政机关或者其上级行政机关可以撤销行政许可。
行政强制
责令改正：有权机关违反法定程序实施行政强制的，由上级行政机关或者有关部门责令改正。
行政处分：对直接负责的主管人员和其他直接责任人员依法给予处分。
国家赔偿：如果因程序违法给行政处罚相对人造成损失的，可以申请国家赔偿。
司法责任
降职、处分：若程序违法并没有造成严重的后果，法官可能受到降职、被处分等处罚。
刑事责任：程序违法若构成犯罪，相关责任人将依法追究刑事责任。
其他后果
诉讼权利侵犯：司法机关及其工作人员违反法定程序侵犯公民诉讼权利的，依法承担责任。
重新作出具体行政行为：法院可以判决被告重新作出具体行政行为，若重新作出的行为与原行为结果相同但主要事实或理由有改变，不属于《行政诉讼法》第五十五条规定的情形。
建议
程序违法的惩罚措施应当严格依法进行，确保行政、司法等机关在行使职权时严格遵守法定程序，以维护法律的公正性和权威性。对于程序违法的处罚，应当综合考虑违法的性质、情节、后果等因素，依法作出合理、公正的处理。同时，应当加强对程序违法的监督和纠正，防止类似违法行为的发生。