做微店小程序的公司选择主要取决于具体需求和预算。以下是一些市场上知名的微店小程序开发公司及其特点：
有赞
优势：有赞是一家知名的电商平台，提供全面的小程序解决方案，包括电商、零售、营销等多个方面。其专业版本功能强大，适合中大型商家。
劣势：价格相对较高，可能不适合预算有限的中小企业。
微盟
优势：微盟主打以微商城为基点的营销解决方案，支持多平台小程序商城，功能丰富，适合需要多渠道推广的商家。
劣势：价格较高，且服务主要以代理为主，可能存在解约风险。
凡科
优势：凡科提供模板类小程序制作工具和服务，拥有大量的企业微信小程序模板案例，价格适中，适合中小企业快速搭建小程序。
劣势：技术团队实力相对较弱，可能存在运行不稳定或功能实现不够细致的问题。
JShop
优势：专注于为企业提供移动互联网解决方案，擅长分销商城、多商家入驻、跨境商城等类型的小程序开发。
劣势：知名度相对较低，市场份额有限。
微店
优势：微店致力于打造基于社交关系的电商购物平台小程序，提供便捷的移动端操作和本地化服务，适合需要社交电商的商家。
劣势：功能系统成熟度不够，且主要以免费版为主，高级功能需要付费。
建议
根据需求选择：首先要明确自己的需求，是需要一个简单的展示类小程序，还是功能全面的电商平台。
考虑预算：不同公司的价格差异较大，要根据预算选择合适的公司。
考察案例：查看公司过往的案例和客户反馈，了解其开发能力和服务质量。
重视服务：选择有良好售后服务的公司，确保在开发过程中和后期维护中能够得到及时的支持。
通过以上分析，可以根据自身需求和预算，选择最适合自己的微店小程序开发公司。