康熙皇帝共有四位皇后，分别是孝庄文皇后、孝诚仁皇后、孝昭仁皇后和孝懿仁皇后。
孝庄文皇后
原名佟佳氏，是康熙皇帝的第一位皇后。她出身于满洲贵族家庭，自幼聪颖好学，精通满洲语和汉语。孝庄文皇后在康熙皇帝眼中不仅才貌双全，而且品行端正，深得他的信任和爱戴。她时常关注宫廷内外的政治动态，为皇帝提供宝贵的建议，并关心民生疾苦，多次向皇帝请命赈灾救济。由于她的出色表现，康熙皇帝对她越发疼爱有加，甚至册封她为皇太后。
孝诚仁皇后
原名赫舍里氏，是康熙皇帝的原配妻子，四大辅政大臣之一索尼的孙女。她与康熙同岁，比他大了三个月，是康熙的祖母太皇太后孝庄亲自定下的皇后人选。孝诚仁皇后与康熙感情甚笃，两人成婚四年后生皇二子承佑，不幸的是这个孩子长到四岁就早夭了。胤礽出生不久，赫舍里氏在产房去世，死的时候年仅二十二岁。谥曰：孝诚恭肃正惠安和俪天襄圣仁皇后。
孝昭仁皇后
原名钮祜禄氏，是康熙皇帝的第二位皇后，辅政大臣一等公遏必隆之女，满洲镶黄旗人。她在康熙十六年册封其为皇后，然而她却只当了半年的皇后便去世了，也只活了二十来岁。钮祜禄氏去世后，康熙帝破格赠谥她为“温僖贵妃”，并是景陵妃园寝中地位最高的一位。
孝懿仁皇后
原名佟佳氏，是康熙皇帝的第三位皇后，领侍卫内大臣佟国维之女，满洲镶黄旗人。她初始是被康熙册封为皇贵妃的，后来佟佳氏病重，许是想要以皇后之称镇住她的性命。康熙二十八年，佟佳氏被立为皇后，但是只当了不到一天的皇后就死了，时年也没超过三十岁。
此外，康熙皇帝的后宫中还有其他妃嫔和宫女，但她们并没有被正式册封为皇后。康熙皇帝在位期间，立过三任皇后，分别是孝诚仁皇后赫舍里氏、孝昭仁皇后钮祜禄氏和孝懿仁皇后佟佳氏。