秦可卿与贾宝玉在《红楼梦》中的关系较为复杂，主要有以下几方面：
现实中的叔侄关系
秦可卿是贾宝玉的侄媳妇，因为她的丈夫贾蓉是贾宝玉的从侄。
梦境中的情人
在《红楼梦》第五回中，贾宝玉在宁国府赏梅花时做了一个春梦，梦中与秦可卿云雨之事，虽然他们并没有在现实中发生关系，但宝玉对秦可卿念念不忘。
性启蒙者
有观点认为，秦可卿在梦中不仅是宝玉的情人，还是他的性启蒙者。宝玉在太虚幻境中看到的“海棠春睡图”以及秦可卿的闺房中的摆设，都暗示了这一点。
精神上的共鸣
秦可卿聪明且敏锐，她能看出贾府的危机，而宝玉对她也有一种朦胧的好感。两人精神上可能有某种共鸣。
综上所述，秦可卿与贾宝玉在现实中是叔侄关系，在梦境中则是情人，并且秦可卿在贾宝玉的性启蒙中起到了重要作用。尽管存在一些争议和猜测，但没有确凿的证据表明他们之间有超越叔侄关系的情感纠葛。