农村合作医疗异地报销的流程如下：
转诊证明
在住院医院找到副主任以上级别的医师，开具转诊证明，并加盖医院公章。
办理跨省就医手续
携带转诊证明前往当地社保局或医保管理部门，办理跨省就医手续，并明确就医的城市及医院名称。
垫付医疗费用
在异地定点医院接受治疗时，可能需要先自行垫付医疗费用。
报销手续
出院时，若当地支持新农合异地结算，可直接在医院办理报销手续，报销原则为多退少补。
若不支持异地结算，则需携带相关材料返回参保地办理报销，建议事先咨询社保工作人员，确保手续完备。
所需材料
携带住院费用清单、出院小结、费用发票、医保卡、身份证等有效证件，到参保地医保部门办理报销手续。
大病保险报销
符合大病保险报销条件的参保人，在基本医疗保险报销后，可向当地医保部门提出大病保险报销申请，需提供相关病历资料、费用发票等证明材料。
报销时限
报销有一定的时限要求，参保人应在费用发生后的一定时间内（如一年内）办理报销手续，逾期可能不予报销。
异地就医备案
参保人因病情需要到异地就医的，应提前向当地医保部门办理异地就医备案手续，需提供本人身份证、医保卡、异地就医原因等相关材料。
报销比例
异地就医报销比例通常低于本地就医报销比例，具体报销比例需遵循当地规定。
建议：
在报销之前，先咨询当地社保工作人员，了解具体的报销政策和流程，避免缺少资料。
保留好所有相关的医疗费用发票、清单、出院小结等证明材料，以便在报销时使用。
如果有条件，尽量选择支持异地结算的医疗机构进行治疗，以简化报销流程。