手机恢复出厂设置与刷机的主要区别如下：
操作性质
恢复出厂设置：将手机恢复到出厂时的状态，包括所有用户数据、应用程序和自定义设置。这个过程不会对手机系统本身进行修改，只是简单地清除数据。
刷机：通过一定的方法更改或替换手机中原本存在的语言、图片、铃声、软件或操作系统。刷机通常涉及安装新的系统，可以是官方提供的固件或经过修改过的第三方固件，刷机前所有数据都会被清空。
数据保留
恢复出厂设置：不会删除存储在手机中的数据，只是将系统恢复到初始状态。用户可以选择是否格式化内部存储空间来清除数据。
刷机：必须清空所有数据，因为新系统需要占用存储空间。用户可以在刷机前备份数据，但刷机过程中数据会被永久删除。
系统改变
恢复出厂设置：系统本身没有改变，只是恢复到了出厂时的默认设置。
刷机：系统内核发生了改变，可以实现更多定制化和个性化功能。刷机可以刷入不同的系统版本，甚至可以通过刷机包增加或删除某些功能。
风险性
恢复出厂设置：相对安全，不会对手机造成严重损坏，只需执行此操作即可解决一些软件问题或准备设备出售。
刷机：存在一定风险，如果操作不当可能导致手机变砖（无法启动）。因此，在执行刷机操作前，建议仔细了解相关风险，并确保备份重要数据。
使用场景
恢复出厂设置：适用于系统卡顿、耗电大等一般性问题，或准备将设备出售给他人时清除个人数据。
刷机：适用于系统崩溃、无法正常启动等严重问题，或希望为手机增加新功能、优化性能时。
总结：
恢复出厂设置：安全且简单，适用于需要清除所有数据或重置系统到初始状态的场景。
刷机：风险较高，但功能强大，适用于需要更换系统或增加新功能的场景。在执行刷机操作前，务必做好数据备份。