单位申请软件版权的流程如下：
确定申请资格与准备工作
明确软件著作权的申请主体，可以是软件开发者、软件所有者或其他依法享有软件著作权的组织或个人。
整理软件相关材料，包括软件的源程序代码、文档说明等，确保材料完整且符合申请要求。
准备申请材料
软件著作权登记申请表：可在版权保护中心或相关部门领取，认真填写各项内容，确保信息准确无误。
软件的源程序代码：通常要求提供一定数量的连续页面，且代码需清晰可辨。
软件的文档说明：包括软件的功能描述、使用方法、技术特点等。
申请人身份证明：个人申请提供身份证原件及复印件，单位申请提供营业执照副本原件及复印件。
前往版权保护中心或指定地点
确定当地版权保护中心或指定受理部门的具体地址和办公时间。
携带准备好的申请材料，前往版权保护中心或指定地点。在前往的过程中，要妥善保管材料，避免丢失或损坏。
提交材料与审核
到达后，向工作人员说明来意，领取申请受理号。
将申请材料提交给工作人员。工作人员会对材料进行初步审核，如有问题会当场指出，需要及时进行补充或修改。
材料提交后，版权保护中心会进行进一步的审核。这个过程可能需要一定的时间，期间可以通过电话或亲自前往咨询审核进度。
现场核查与补正
在审核过程中，可能会安排工作人员对软件进行现场核查。核查软件的实际情况与提交的材料是否相符。
如果发现问题，需要按照要求进行补正，及时提交补充材料。
领取证书
审核通过后，可以领取软件著作权登记证书。
建议
提前准备：提前准备好所有必要的材料，确保材料的真实性和完整性。
选择途径：可以选择自己办理或委托专业版权代理服务机构办理，以便节省时间和成本。
及时咨询：在申请过程中，及时与版权保护中心或代理机构沟通，了解审核进度和需要补正的事项。