软件项目的产出可以通过以下几种方法来计算：
软件产出量
软件产出量可以表示为完成的软件功能、行代码数或交付的软件系统。
软件投入资源
软件投入资源可以包括开发时间、开发人员数量或开发成本。
收益计算
收益可以通过费用E（产品合同费用）加上费用J（运维维护合同费用），再减去其他费用和增值税费用来计算。
具体计算步骤：
确定软件产出量
评估完成的软件功能点数。
统计编写的代码行数。
交付的软件系统数量或版本。
评估软件投入资源
计算开发所需的时间（人天）。
统计开发人员的数量。
估算开发成本（包括人力、技术工具、测试等费用）。
计算软件生产率
使用公式：软件生产率 = 软件产出量 / 软件投入资源。
计算收益
收益 = 费用E（产品合同费用） + 费用J（运维维护合同费用） - 其他费用和增值税费用。
示例：
假设一个软件项目完成了100个功能点，编写了近10万行代码，并交付了2个版本。开发过程中共投入了100人天，开发人员数量为20人，总开发成本为50万元。
软件产出量
100个功能点
10万行代码
2个版本
软件投入资源
100人天
20人
50万元
计算软件生产率
软件生产率 = 100个功能点 / 100人天 = 1个功能点/人天
计算收益
收益 = 10万元（产品合同费用） + 20万元（运维维护合同费用） - 5万元（其他费用和增值税费用） = 25万元
通过以上步骤，可以较为准确地计算出软件项目的产出和收益。建议在实际项目中，结合具体情况进行详细的评估和计算，以确保数据的准确性和可靠性。