在软件中多线程运行时，合理分配CPU资源的方法包括：
合理设置线程数量：
根据CPU的核心数和任务类型，合理设置线程数量。过多的线程可能导致上下文切换开销过大，而过少的线程可能无法充分利用CPU资源。
使用线程池：
线程池可以有效地管理和复用线程，避免频繁创建和销毁线程带来的开销。
优化任务划分：
将任务划分为更小的子任务，以便更好地利用CPU缓存，减少内存访问延迟。
避免竞争条件：
确保多个线程访问共享资源时，使用适当的同步机制（如互斥锁、信号量等）以避免竞争条件，从而减少线程间的等待时间。
使用并行编程模型：
例如OpenMP、TBB（Threading Building Blocks）等，它们可以帮助程序员更容易地编写并行代码，提高性能。
考虑负载均衡：
在多核处理器上，确保各个核心的负载均衡，避免某个核心过载而其他核心空闲。
优化数据结构和算法：
选择合适的数据结构和算法，以提高程序的执行效率。
使用超线程技术：
如果CPU支持超线程技术，可以利用它来提高性能。
监控和调优：
使用性能分析工具（如perf、gprof等）来监控程序的性能，并根据分析结果进行调优。
在C中，可以使用Task Parallel Library （TPL）来简化多线程任务的创建和管理，例如使用`Task.Run（）`或`Parallel.ForEach（）`等方法将工作分配给多个线程。同时，可以根据系统资源调整线程数量，使用`Environment.ProcessorCount`属性获取处理器的内核数量，从而合理地分配线程。
在Java中，可以通过继承Thread类或实现Runnable接口来创建线程，并使用线程池来管理线程，例如使用`Executors`类创建线程池。此外，Java的线程调度机制会根据线程的优先级和状态来决定线程的调度，并将线程分配到多核CPU上运行。
总的来说，合理分配多线程资源需要综合考虑任务类型、CPU核心数、系统负载、数据同步等多个因素，选择合适的方法和技术来提高程序的性能和响应速度。