软件开发的毛利计算通常遵循以下公式：
\[ \text{毛利} = \text{收入} - \text{成本} \]
其中，收入是指软件销售或服务所获得的总收入，成本则包括直接成本和间接成本。
收入
软件销售收入：包括一次性软件销售、许可证费用等。
服务收入：包括软件定制开发、技术支持、维护服务等。
订阅收入：如SaaS模式下的月度或年度订阅费用。
其他收入：如培训服务、咨询服务等。
直接成本
开发人员工资和福利：开发人员的基本工资、奖金、福利等。
软件工具和许可证费用：开发过程中使用的软件工具、开发环境、测试工具等费用。
服务器和云服务费用：开发、测试和部署过程中使用的服务器、存储和网络资源的费用。
第三方服务费用：使用第三方API、库或服务的费用。
间接成本
租金：办公场所的租金费用。
水电：办公环境的水电费用。
办公用品：日常办公所需的办公用品费用。
其他间接费用：如管理费用、营销费用等。
在具体计算时，首先需要明确每一笔收入和成本的具体金额，并进行详细记录和分析。然后，按照公式进行计算，得出毛利的百分比。
例如，某软件开发公司的某项目收入为100万元，直接成本为60万元，间接成本为20万元。则该项目的毛利计算如下：
\[ \text{毛利} = 100 \, \text{万元} - 60 \, \text{万元} - 20 \, \text{万元} = 20 \, \text{万元} \]
毛利率则为：
\[ \text{毛利率} = \left（ \frac{20 \, \text{万元}}{100 \, \text{万元}} \right） \times 100\% = 20\% \]
通过以上步骤和公式，可以较为准确地计算出软件开发的毛利，并进一步分析企业的盈利能力和经营状况。