软件著作权的申请费用如下：
软件著作权登记申请费：
一般为250元/件次。如果申请登记多种文档，则每增加一种文档，增收80元。
软件著作权合同登记费：
每次100元。
软件著作权合同登记证书费：
50元/件。
变更或补充登记费：
150元/件次。
请求延期处理费：
第一次100元/件次，第二次200元/件次。
软件源程序封存保管费：
100页内120元，超过100页的，每增加一页增收2元。
其他费用：
例如，代理费用可能在500元到800元不等，具体费用根据不同的申请用途和代理服务内容而定。
建议
自行申请：如果时间充裕且对流程熟悉，可以选择自行申请。需要准备的材料包括申请表、源程序代码、使用说明书、著作权人身份证明等，并缴纳相应的费用。
代理申请：如果时间紧迫或对流程不熟悉，建议选择代理申请。代理申请可以节省时间，提供专业的申请服务，并可能包含额外的增值服务，但费用相对较高。
根据以上信息，选择适合自己的申请方式和费用方案，可以更高效地完成软件著作权的申请。