软件重新签名的方法如下：
方法一：使用re-sign.jar
环境配置
设置JAVA JDK环境变量：
新增`JAVA_HOME`，值为JDK安装目录，例如：`C:\Program Files （x86）\Java\jdk1.6.0_43`。
在`PATH`中添加`%JAVA_HOME%\bin`。
设置ANDROID环境变量：
新增`ANDROID_HOME`，值为SDK所在目录，例如：`D:\Program Files （x86）\adt-bundle-windows-x86-20130522\sdk`。
在`PATH`中添加`%ANDROID_HOME%\tools`和`%ANDROID_HOME%\platform-tools`。
使用re-sign.jar
双击或通过命令行`java -jar re-sign.jar`启动。
拖动需要签名的APK文件到打开的窗口，自动使用本地签名文件进行重签名。
方法二：使用jarsigner
环境配置
确保JDK版本在1.6以上，因为1.6以下的版本可能存在问题。
使用jarsigner
命令示例：
```sh
jarsigner -verbose -keystore xxx.keystore -signedjar 生成的apk 被签名的apk xxx.keystore的别名
```
输入密码后，完成签名过程。
方法三：使用keytool生成签名证书
生成签名证书
使用JDK自带的`keytool`工具：
```sh
keytool -genkey -alias androidauto.keystore -keyalg RSA -validity 20000 -keystore android.keystore
```
输入相关信息并生成证书文件`android.keystore`。
删除之前APK文件的签名
解压APK文件。
删除解压后文件夹中的`META-INF/MANIFEST.MF`文件。
注意事项
签名证书：确保使用的签名证书是有效的，并且与要签名的软件匹配。
签名顺序：在重新签名之前，建议先删除原有签名，以确保新的签名能够正确应用。
环境变量：确保`JAVA_HOME`和`ANDROID_HOME`环境变量设置正确，以便工具能够找到所需的JDK和SDK路径。
通过以上步骤，你可以选择合适的方法对软件进行重新签名。选择哪种方法取决于你的具体需求和操作环境。