软件系统密级的填写应当遵循以下原则：
根据信息最高密级确定 ：机关单位应当根据涉密信息系统存储、处理信息的最高密级确定系统的密级。密级分类：
涉密信息系统按照涉密程度分为绝密级、机密级、秘密级。
标注方式
绝密级：
适用于存储、处理最高密级信息的系统，必须严格限制访问权限。
机密级：适用于存储、处理机密级信息的系统，访问权限应受到较高限制。
秘密级：适用于存储、处理秘密级信息的系统，访问权限应受到一定限制。
标注位置：
正确的文件密级顶格标注在版心左上角第二行位置（即份号的下方），字体为黑体字三号，保密期限中的数字用阿拉伯数字进行标注，秘密等级和保密期限之间用“”进行分隔。
建议
明确信息分类：首先，要明确软件系统中存储和处理的信息的最高密级，这是确定系统密级的基础。
规范标注：按照规定的格式和位置标注密级，确保标注的清晰、规范，便于管理和查阅。
定期审查：定期对软件系统的密级进行审核和调整，确保其与实际存储、处理的信息密级一致。
通过以上步骤，可以确保软件系统密级的正确填写，从而有效保护信息安全。